小程序商城和H5商城各有优势，选择哪个更好取决于具体的需求和情况。

小程序商城的优势：

用户体验好：小程序可以直接在微信内打开，无需下载安装，用户可以快速访问和使用。

功能丰富：小程序可以调用微信的各种接口和功能，如支付、地理位置、扫码等，可以提供更多的交互和功能。

推广便利：小程序可以通过微信的搜索、推荐等功能进行推广，用户可以方便地找到和使用。

用户粘性高：小程序可以通过消息推送、订阅消息等功能与用户保持互动，提高用户粘性和复购率。

H5商城的优势：

跨平台兼容性好：H5商城可以在各种浏览器上访问，不受限于特定的平台和设备。

开发成本低：H5商城的开发成本相对较低，无需开发专门的小程序，只需开发网页即可。

更新迭代快：H5商城的更新和迭代可以直接在服务器端进行，无需用户更新，可以快速推出新功能和优化。

综上所述，如果你的目标用户主要在微信平台上，且需要更好的用户体验和功能交互，那么小程序商城可能更适合；如果你的目标用户跨平台使用，且对开发成本和更新迭代速度有要求，那么H5商城可能更适合。